सुब्रमण्य स्वामी मंदिर, चंगनाचेरी में कोट्टयम से लगभग 20 किमी. की दूरी पर स्थित है। यह केरला के कुछ मंदिरों में से है जो भगवान सुब्रमण्य को समर्पित है। यह मंदिर काफी प्राचीन है जो लगभग 753 ई्. का आंका जा रहा है। यह पहला ऐसा मंदिर है जो जाति, वर्ग और धर्म में अंतर न करते हुए सभी श्रद्धालुओं के लिए खुला था।
इस मंदिर की मूर्ति 6 फीट लंबी है। इसके अलावा, भगवान सुब्रमण्य की मूर्ति में धारण वेल यानि भाला पृथ्वी की ओर इशारा करते हुए बना है न कि ऊपर की ओर। पल्लीमेट्टा उत्सव, इस मंदिर में मनाया जाने वाला वार्षिक त्यौहार है। यह त्यौहार दस दिनों तक मनाया जाता है और हिंदुओं के धनु माह में मनाते हैं जो साल के नवंबर और दिसम्बर के दौरान पड़ता है।
इस त्यौहार के दौरान निभाई जाने वाली मुख्य परंपरा चाकिअरकुथ है। सुब्रमण्य स्वामी मंदिर का कार्यभार और प्रबंधन उर्झमा देवासवम बोर्ड़ के हाथों में है। एक प्राचीन मंदिर होने के नाते, यहां दर्शन करने अवश्य आएं।