प्रमुख संघराज्य क्षेत्र होने के कारण पांडिचेरी का अपना रेलवे स्टेशन है। देश के सभी बड़े शहरों से आने वाली रेलगाडि़याँ पांडिचेरी में रुकती हैं। रेलगाड़ी से पांडिचेरी की यात्रा भी एक अच्छा विकल्प है।