चंद्रमौलीश्वरा मंदिर उडुपी शहर में स्थित प्राचीन मंदिरों में से एक है। अपनी प्राचीन उपस्थिति के परिणाम स्वरूप यह उडुपी के आज्या के रूप में भी जाना जाता है। प्रमुख धारणा यह है कि, कृष्ण मंदिर जाने से पहले इस मंदिर की यात्रा करनी चाहिए। यह चालुक्य वास्तुकला के सबसे अच्छा उदाहरणों में से एक है।
इतिहास से साबित होता है कि मंदिर का निर्माण 7 वीं या 8 वीं सदी में हुआ था। यह अनंतेश्वर मंदिर के रूप में जाना जाता है। चंद्रमौलीश्वरा मंदिर की उत्पत्ति के पीछे काफी दिलचस्प मिथक है। एक बार भगवान चंद्रमा को दक्षा प्रजापति से शाप मिला। भगवान चंद्रमा ने इस जगह पर भगवान शिव को खुश करने के तप किया था।
तब से जगह चंद्रमौलीश्वर के रूप में जाना जाता है। यह मंदिर मणिपाल से 3 किमी, मलपे से 6 किमी, मंगलौर से 60 किमी और कुंदापुर से 30 किमी दूर है। निकटतम हवाई अड्डा और रेलवे स्टेशन मंगलौर में है।