मई, जून, सितंबर और नवंबर के महीनों में इस जगह का भ्रमण आदर्श माना जाता है,क्योंकि इस अवधि के दौरान मौसम काफी सुखद रहता है।
(अप्रैल से जुलाई ): अप्रैल के महीने से यमुनोत्री में गर्मी के मौसम की शुरुआत होती है जो जुलाई तक चलती है। इस मौसम के दौरान न्यूनतम और अधिकतम तापमान क्रमशः 6 डिग्री सेल्सियस व 20 डिग्री सेल्सियस दर्ज किया गया है। मई और जून महीनों के बीच काफी गर्मी रहती है।
(जून से अगस्त तक): यमुनोत्री में मानसून का मौसम जून के महीने में शुरू होता है और अगस्त तक रहता है। इस मौसम के दौरान भारी वर्षा होती है।
( अक्टूबर से मार्च): सर्दियों का मौसम अक्टूबर से मार्च के बीच रहता है। इस समय के दौरान भारी वर्षा होती है और तापमान शून्य स्तर से नीचे चला जाता है। दिसंबर और जनवरी के महीने बाहरी गतिविधियों के लिए उपयुक्त नहीं हैं।