पोखरण के लिए निकटतम प्रमुख रेलखंड जोधपुर रेलवे स्टेशन है। यह उदयपुर, जैसलमेर, आगरा, जयपुर, नई दिल्ली और अहमदाबाद सहित प्रमुख भारतीय शहरों से नियमित गाड़ियों द्वारा अच्छी तरह से जुड़ा है। आगंतुक स्टेशन से गंतव्य तक पहुंचने के लिए किराये की टैक्सियां ले सकते हैं।