अमृतसर रेल मार्ग से भारत के ज्यादातर हिस्सों से जुड़ा हुआ है। दिल्ली, मुंबई, कोलकाता और जम्मू से अमृतसर के लिए प्रतिदिन ट्रेनें मिलती हैं। समझौता एक्सप्रेस नाम से विशेष ट्रेन वाघा-अत्तारी बॉडर के जरिए अमृतसर को लाहौर से जोड़ती है।