कराईकुडी की यात्रा का सबसे अच्छा मौसम अक्टूबर से फरवरी के बीच होता है। इस दौरान मौसम ठंडा और सुखदायी होता है। इस अवधि में आर्द्रता भी कम रहती है।
कराईकुडी में गर्मियों का मौसम बहुत गर्म और शुष्क होता है। मार्च से जून तक यहां भयंकर गर्मी पड़ती है। दोपहर में बाहर निकलना मुश्किल होता है। गर्मियां की शाम, दिन की अपेक्षा ठंडी होती है। पर्यटकों को इस मौसम में कराईकुडी की सैर की सलाह नहीं दी जाती है।
कराईकुडी में बारिया जुलाई और अगस्त में काफी होती है। इस दौरान तूफानी हवाएं चलती है। भारी बारिश के कारण वातावरण में आर्द्रता रहती है। इस अवधि में तापमान 30 डिग्री सेल्सियस तक हो जाता है। इस मौसम में नमी सबसे ज्यादा होती है।
कराईकुडी में सर्दियों की शुरूआत, नवंबर से होती है। दिसम्बर यहां का सबसे ठंडा महीना होता है। लेकिन सर्दियों के दौरान यहां भयंकर जाड़ा नहीं पड़ता है। आप कम ऊनी कपड़ों में आराम महसूस करेगें। शाम और रात, दिन की अपेक्षा ठंडे होते है। शॉल या जैकेट साथ में अवश्य लाएं।