उच्च ऊंचाई के कारण मनाली में मौसम वर्ष भर अच्छा रहता है। गर्मियों में मौसम खुशनुमा रहता है जबकि सर्दियों में मनाली में भयंकर सर्दी होती है। भारी बर्फबारी भी मनाली में हर साल सर्दियों के दौरान होती है। इसलिए पर्यटकों को सर्दियों के मौसम में न आने की सलाह दी जाती है क्योकि इस दौरान सड़क खराब हो जाती है और यात्रा करने लायक नहीं रहती हैं।
( मार्च से जून ) : मनाली में गर्मी का मौसम मार्च से शुरू होता है और जून के महीने तक रहता है। गर्मियों के दौरान मनाली में अधिकतम तापमान 25 डिग्री सेल्सियस और न्यूनतम तापमान 10 डिग्री सेल्सियस दर्ज किया गया है। सुबह के समय यहां का वातावरण और मौसम खुशनुमा रहता है लेकिन दिन बढ़ने के साथ - साथ तापमान में बढ़ोत्तरी होती जाती है। इस दौरान पर्यटक यहां आराम से घूमने आ सकते हैं।
( जुलाई से सितम्बर ) : मनाली में मानसून जुलाई से सितम्बर अन्त तक रहता है। इस दौरान पर्यटकों को मनाली न आने की सलाह दी जाती है। बारिश में मनाली में पहाड़ो के खिसकने की कई घटनाएं सामने आती है इसलिए बारिश के मौसम पर्यटक यहां भूलकर भी न आएं।
( अक्तूबर से फरवरी ) : मनाली में अक्टूबर के महीने में सर्दी के मौसम की शुरुआत हो जाती है जो फरवरी तक कड़ाके की रहती है। इस दौरान भारी बर्फबारी होती है। सर्दियों के दौरान न्यूनतम तापमान -7 तक पहुंच जाता है।