बरसात के बाद मोतीहारी का मौसम काफी खुशगवार हो जाता है और यह समय घूमने के नजरिए से काफी अच्छा माना जाता है। बरसात के बाद यहां की प्राकृतिक सुंदरता भी देखते ही बनती है।
मोतीहारी में भीषण गर्मी पड़ती है और इस दौरान तापमान 45 डिसे तक पहुंच जाता है। यहां मार्च से मई का महीना गर्मी का रहता है।
जून से अगस्त तक मोतीहारी में मुसलाधार वर्षा होती है। इस दौरान तापमान में भी काफी गिरावट आ जाती है।
मोतीहारी में कड़ाके की ठंड पड़ती है। इस दौरान औसत तापमान कभी भी 20 डिसे से ऊपर नहीं जाता है। कई बार यहां न्यूनतम तापमान एक डिसे तक पहुंच जाता है। ठंड का मौसम दिसंबर से शुरू होकर फरवरी तक रहता है।