सुब्रमण्या स्वामी मंदिर शहर का एक महत्वपूर्ण मंदिर है। यह मंदिर इंद्रकीलाद्री पर्वत पर है और इसका आगे का हिस्सा कृष्णा नदी और शहर की ओर है। स्कंडा शाष्ठी मंदिर में मनाया जाने वाला प्रमुख त्योहार है और इस दौरान बड़ी संख्या में श्रद्धालू आते हैं। सुब्रमण्या स्वामी मंदिर का रख-रखाव प्रसिद्ध इड्डीपल्ली परिवार द्वारा किया जाता है।