मलयाट्टूर का निकटतम रेलवे स्टेशन एर्नाकुलम है। एर्नाकुलम से सभी प्रमुख शहरों के लिए रेल सेवा उपलब्ध है। यहाँ से उपलब्ध नियमित रेल सेवा केरल के अन्य सभी क्षेत्रों को इस स्थान से जोड़ती है। वे लोग जो रेल द्वारा पहुँचते हैं वे टैक्सी या रिक्शे के द्वारा मलयाट्टूर पहुँच सकते हैं।