मोकोकचुंग में कोई रेलवे स्टेशन नहीं है। असम में स्थित मरीआनि मोकोकचुंग के लिए सबसे नजदीकी रेलवे स्टेशन है। मरीआनि की लोकेशन इस प्रकार से है कि डिब्रूगढ़ जाने वाली सभी ट्रेनें यहाँ से होकर गुजरती हैं। आप मरीआनि रेलवे स्टेशन से बस या टैक्सी द्वारा आसानी से मोकोकचुंग जा सकते हैं। मरीआनि मोकोकचुंग से 85 किमी दूर है जो कि मोकोकचुंग और दीमापुर के लिए सबसे नजदीकी रेलवे स्टेशन है।