खंडवा मुख्य ट्रेन जंक्शन पर स्थित है। खंडवा रेलवे स्टेशन, मध्य प्रदेश के दो प्रमुख शहर भोपाल और इंदौर से दैनिक रेलों द्वारा जुडा है। इस स्टेशन से दिल्ली, मुंबई, कोलकाता, कोचीन, बेंगलुरु, हैदराबाद, जम्मू, पटना जैसे भारत के कई शहरों के लिए ट्रेनों की सेवा उपलब्ध है।