मदुरई में एक घरेलू हवाई अड्डा है जो शहर से 10 किमी. की दूरी पर स्थित है। मदुरई से मुंबई, दिल्ली, चेन्नई और बैंगलोर तथा अन्य शहरों के लिए नियमित उड़ानें उपलब्ध हैं। निकटतम अंतरराष्ट्रीय हवाई अड्डा चेन्नई है जो भारत के प्रमुख शहरों तथा विदेशों से जुड़ा हुआ है।